Το βαμβάκι απειλείται από τη ριζοκτονια και το φουζάριο μάλλον το σπόρο και τις ρίζες των νεαρών φυταρίων.
Μπορούν να προκαλέσουν σήψη και νέκρωση των ριζών και του λαιμού που έχει ως αποτέλεσμα το φυτό να ξεραθεί.
Οι ανδρομυκώσεις είναι μία ασθένεια που προσβάλλει το αγγειακό ξυλώδες σύστημα του φυτού όπου μέσω αυτού μεταφέρει το νερό.
Το αποτέλεσμα από την προσβολή είναι η ξήρανση του φυτού καθώς έχει έλλειψη από νερό.
Η αλτενάρια προσβάλλει το βαμβάκι στα φύλλα, τα στελέχη,τις ίνες και τα καρύδια.
Τα συμπτώματα που θα παρουσιάσει είναι μικρές καστανές κηλίδες σταφυλά όπου αργότερα επεκτείνονται και δημιουργούν ξήρανση.
Ένα ακόμα πρόβλημα που εάν παρουσιαστεί στο βαμβάκι μπορεί να προσβάλει όλα τα τμήματα του φυτού είναι η βακτηριωση.
Η βακτηριωση σε αρχικό στάδιο Εμφανίζεται στην Κάτω πλευρά των φύλλων και είναι ειδατώδεις κηλίδες που μεταγενέστερα γίνονται μαύρες και νεκρωτικές.
Το αποτέλεσμα της προσβολής είναι οι βλαστοί να μαυρίσουν και να σαπίσουν.
Οι εντομολογικοι εχθροί του βαμβακιού είναι οι αφιδα, αλευρώδης, καραφατμέ, θρίπας, τετράνυχος, πράσινο σκουλήκι, ρόδινο σκουλήκι, και λύγκος.
Φώτης Κονδύλης
